藻类对养殖动物起到供氧的作用，通过光合作用产生氧气，是水中溶氧的主要来源，有益藻类可作为养殖种类的生物饵料。我们将部分常见藻类做了统计整理，并且将其在显微镜下的特点整理出来。
蓝藻门
蓝藻门的藻类多数属于有害藻。蓝藻是一种浮游生物，有单细胞的，也有多细胞的。容易在富营养化的水中大量爆发。池塘中出现蓝藻时就应该提高警觉，可以通过在早期换掉上层水除去蓝藻。如果使用了杀死蓝藻的药物，切记要使用解毒药！蓝藻死后是有毒的，产生的毒素将会对养殖动物构成威胁。下面是几种蓝藻门的常见藻类：

蓝纤维藻
群体胶被无色透明

色球藻
群体胶被厚，且单独都有衣鞘，背靠背的两个小球。

微囊藻
小型的细胞且没有鞘的包覆。

颤藻
分布广，种类多。

念珠藻
藻体为多细胞的丝状体。

绿藻门

藻类植物中种类繁多的一个门。形态多样，有单细胞、多细胞等类型。多细胞个体的体形有球形、盘状、分枝或不分枝的丝状体、以及叶状体、管状体、枝状体等。细胞壁主要由纤维素组成。细胞中有一至多个显著的核。都含叶绿体，但叶绿体的数目和形状因种类而异。所含光合色素成分与高等植物相似，有叶绿素a、b，α-、β-胡萝卜素和叶黄素等，不含藻胆素。

小球藻
球形单细胞淡水藻类

新月藻
绝大多数呈新月形，弯曲，少数平直。

卵囊藻
常见的浮游绿藻

盘星藻
定形群体，细胞排列在一个平面上，大体呈辐射状。

鞘藻
植物体丝状，不分枝或分枝。

栅藻
常见浮游藻类，繁殖快，营养价值高。

水绵藻
不分枝的丝状体。细胞内具带状螺旋形载色体。

双星藻
不分枝的丝状体。

鼓藻
鼓藻有三层细胞壁，壁上充满孔道及果胶质的针状体。

月牙藻
细胞新月形，两端尖，单个细胞有一个大的色素体。

硅藻门

针杆藻

盒形藻

角毛藻

海链藻

小环藻

舟形藻

根管藻

裸藻门
囊裸藻

扁裸藻

血红裸藻

纤细裸藻

膝曲裸藻

绿裸藻

甲藻门

多甲藻属

角藻属

金藻门

等鞭金藻属

硅鞭金藻属

三毛金藻属

 

黄藻门

黄丝藻属

气球藻属

无隔藻属